聚丙烯酰胺以及水解體是低毒的。大多數聚丙烯酰胺不刺激肌膚。然而，有一些水解體可能有殘剩的堿性，當多次、長久碰觸時會有刺激性。在裝卸、使用時應盡量減少與肌膚立刻碰觸。許多聚丙烯酰胺產品已被美國環境保護局和食品、藥品管理局批準可用為飲用水處理、糖汁清撤的水果、蔬菜清洗等。
　　但是，應用的最大劑量是有節制的。丙烯酰胺在聚集化合物中殘余量應小于0.05%。聚丙烯酰胺原來通常沒有毒性，因它在使用身體后，絕大部分在短期內排出體外，很少被消化道吸收。大多數商品也不刺激皮膚，只能有一些水解體可能有殘剩堿，當多次、長久碰觸時會有刺激性。
　　聚丙烯酰胺的毒性來自殘余的丙烯酰胺獨立體和生產過程中夾帶的有害金屬。丙烯酰胺為神經性致毒劑，對神經系統有損傷作用，中毒后表現出機體無力，運動失調等狀況。由于聚丙烯酰胺的起始生產用原材料是具有高毒性的氰化物-丙烯腈，人們對聚丙烯酰胺的毒性重視是很自然的情況。
　　丙烯腈在國外工業化廢清水的排放標準規定為0.1×10-6(英、蘇)，0.2×10-6（美）。實際上，就聚丙烯酰胺來說，因聚丙烯酰胺中丙烯腈純度通常在3×10-6如下，若以200×10-6的聚丙烯酰胺處理污水為最大添加量，丙烯腈在被處理水中的含量最大只能0.006×10-6，故聚丙烯酰胺中丙烯腈對水質的作用能夠不考慮。
　　丙烯酰胺的毒性最早是在1954年美國氰胺我廠就開頭實驗，其后美國道氏化工公司有進行了系統的動物測驗，海外這一類實驗總是延續至今，實驗表明，丙烯酰胺具有中等毒性，在急性中毒方面，10%的丙烯酰胺溶解在水里接觸肌膚后易被吸收并導致刺激。40%的高濃度溶液與眼碰觸可造成結膜和角膜致痛傷害。
　　丙烯酰胺對貓的內覆膜注射一下劑量為100mg/kg體重，會引起嚴重的神經中毒；200mg/kg時會導致猴子死亡。
　　故國際研究人員心得聚丙烯酰胺的工業暴露量應當把持在工人每日呼吸量不超過0.05mg/kg體重，居民吸收總量制約在萬分之5mg/kg體重。
　　國際對非離子和陰離子聚丙烯酰胺的毒性做過非常多研究。研究證明，不管對動物喂養，身體接觸都未導致異常現象。有些陽離子聚丙烯酰胺狀態就繁雜得多，這是由于陽離子聚丙烯酰胺中引入的胺基類等基團，其毒性時常數十至數百倍地超出陰離子、非離子聚丙烯酰胺。他們的慢性毒性，正在更多分析中。
　　多種丙烯酰胺共聚物毒性應獨自顧慮。
　　干燥的陽離子聚合物有毒。其經口（對鼠）和經肌膚（對兔）的半致死劑量（LD50）分頭高于5.0g/kg體重和20g/kg體重。
　　非離子、陰離子和陽離子乳液聚合物的經口（對鼠）和經皮膚（對兔）的LD50值都大于10g/kg體重。對兔持續的初步刺激分析表明，干燥的非離子和陽離子聚合物不刺激肌膚，對眼的刺激性也極小。干燥的陰離子聚丙烯酰胺對試驗動物的眼睛或皮膚是無刺激性。非離子乳液聚合物對兔子的眼里產生嚴重的刺激性，而陰離子和陽離子的乳液聚合物對兔子的眼睛發生極微的刺激性。聚丙烯酰胺工業產品中殘留丙烯酰胺的含量各國衛生部門都有規范，普遍為0.5%-0.05%。
　　如用作水的通常純化處理時，丙烯酰胺含量在0.2%下面；用做直接食用污水處理時，須在0.05%以下。國際康健衛生組織1985年出版的丙烯酰胺標準指出：聚丙烯酰胺中丙烯酰胺殘留量控制在0.05%下面并控制用量時，處置后水中丙烯酰胺的含量將小于0.25μg/L，符合大多數國家飲水專業化標準。
　　排放水中丙烯酰胺的純度理當在1-50μg/L相互之間的，因此歐美主要領域通常規定，食用污水處理及食品工業用聚丙烯酰胺中殘留丙烯酰胺含量應當在0.05%以下，并把持聚丙烯酰胺用量。