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聚合物降解菌的分離篩選及鑒定

發布日期:2015-03-05 17:36:11
聚合物降解菌的分離篩選及鑒定
聚合物降解菌的分離篩選及鑒定,聚丙烯酰胺是一種高分子量的聚合物,常規菌種降解難度很大。本研究通過采自聚 合物含量高的陜北油田地區的泥漿池廢液和周邊土壤中的樣品,分離篩選對聚丙烯酰胺 環境有高度適應能力和對聚合物有降解潛力的菌株,并對最終得到目標菌種進行分離鑒 定。
1實驗材料
1.1菌種來源
菌種由陜西長慶43-1號油田泥漿池廢液和4-23號油田廢棄泥漿池周圍土壤中分別分
離篩選得到。 1.2主要試劑與儀器
主要試劑列表如下:
表2-1主要實驗試劑 Table2-1 Main Reagents
試劑名稱生產公司
蛋白酶K西安潤德生物技術有限公司
RNaseA西安潤德生物技術有限公司
三(羥甲基)胺基甲烷(Tris)西安市雁塔區保昕化學試劑有限公司
十六烷基三甲基溴化胺(CTAB)陜西昕泰生物科技發展有限公司
十二烷基硫酸鈉(SDS)西安潤德生物技術有限公司
聚乙烯聚吡咯烷酮(PVPP)西安永屹生物技術有限公司
Tris飽和酚上海索萊寶生物科技有限公司
溴化乙錠i:EB)西安國安生物科技有限公司
其它試劑:氯化鈉、乙酸鈉、EDTA、氯仿、異戊醇、異丙醇、乙醇等,均為分析 純。
主要儀器列表如下:
表2-2主要實驗儀器 Table2-2 Main experimental apparatus
儀器名稱生產公司
SartoriusBS210S 電子天平北尕賽文利斯天平有限公司
Eclipse E200 顯微鏡曰本尼康公司
顯微攝像系統日本尼康公司
LDZX-40BI立式壓力蒸汽滅菌鍋上海申安醫療器械廠
GZX-DH400-BS-II電熱恒溫干燥箱上海躍進醫療器械廠
SXK-103超凈工作臺安徽蚌埠凈化設備廠
DNP-9052細菌培養箱上海躍進醫療器械廠
ZHWY-A211C臥式旋轉型搖床上海智城分析儀器制造有限公司
SPX-250IC人工氣候箱上海博迅實業有限公司
PYX-DHS-35X40隔水式電熱恒溫培養箱上海市躍進醫療器械廠
手持式土壤PH測試儀廣州銘睿電子土壤酸度計
土壤水份測定伩哈爾濱宇達電子技術有限公司銷售部
1.3培養基
菌種篩選培養基。其組成如下:乳酸鈉4ml,KH2P040.02g,聚合物降解菌的分離篩選及鑒定,NaCl 10g, MgS04 *7^0 為0.2g,維生素C0.2g,酵母膏l.Og,模擬水為1000ml的lg/LHPAM。滅菌冷卻后加 入經紫外滅菌的FeS04(NH4)2S04 • 6H20。
實驗用部分水解聚丙烯酰胺分子量1.7-2.2X107,水解度18.6-29.3%,高效pH范圍 4-13,固含量之90%,殘單0.05-0.15%,白色顆粒粉末,由鞏義市拓普凈水材料有限公司 提供。
富集培養基:在菌種篩選培養基中分別加0.1%酵母膏和0.1%蛋白胨,用于菌株的 平板培養和斜面保存。
細菌分離及斜面培養基:蛋白胨l〇g,牛肉膏4.5g,氯化鈉5g,瓊脂20g,蒸餾水 lOOOmL, pH 值 7.2?7.5。
真菌分離及斜面培養基(PDA培養基):馬鈴薯200g煮出液,蔗糖20g,瓊脂15?20g, 蒸餾水1000 mL, pH值自然。
2實驗方法
2.1菌株的富集
實驗樣品采自陜西長慶43-1號油田泥漿池廢液周圍土壤和4-23號油田廢棄泥漿池 周圍土壤的共4處采樣點。采樣方法:用小鐵鍬除去地面浮土后,取地表或地下10 cm 的土壤樣品,置于-2(TC保存。
表2-3采集土壤特性
Table2-3 Collected soil characteristics
編號PH含水率
43-1號采樣點18.558.3%
43-1號采樣點28.898.5%
4-23號采樣點18.3715.1%
4-23號采樣點28.2115.6%
將所采集的HPAM污染土樣稱量10g,接入200mL已滅菌的富集液體培養基中, 在30°C旋轉式搖床中(轉速200 r/min)旋轉培養4d后,移取一定量含菌的富集培養液接 入新鮮滅菌過的富集培養基中,在相同條件下培養4d,一共重復3次,得到富集的HPAM 降解混合菌。
2. 2菌株的篩選
取O.lmL菌液涂布于以HPAM為唯一碳源的篩選培養基上,30°C培養48h,待平板 長出菌落后選擇生長良好且性狀差異明顯的菌落,連續平板劃線純化,將純化的菌株轉 接于篩選養基斜面培養Id后4"C保存于冰箱。
2. 3形態鑒定
根據《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》(Buchanan R.E. and Bergey N.E., 1994)和《常見細菌系統鑒定手冊》(東秀珠和蔡妙英,2001)的方法,進行各菌株 的形態鑒定,包括細菌個體形態觀察(革蘭氏染色、芽孢染色和菌體大小等)和菌落形態 觀察(菌落形態、菌落質地、菌落邊緣、光學特性和菌落的顏色等)。
2. 4菌株的常規生理生化性質測定
挑取篩選到的菌株分別接入篩選養基中,在溫度30°C、轉速200 r/min的旋轉式搖 床中搖瓶培養4d后,將得到的菌液在篩選養基平板上劃線,并在30°C的細菌培養箱中 培養活化l-2d。選擇活化良好的菌株作為實驗菌株,參照《簡明第八版伯杰細菌鑒定手 冊》[48]《常見細菌系統鑒定手冊》[49]對篩選的細菌進行生理生化性質測定,將細菌初步 鑒定到屬。鑒定方法主要有革蘭氏染色法、芽孢染色法、V-P實驗、葡萄糖氧化發酵實 驗、淀粉水解試驗、甲基紅試驗、接觸酶試驗、明膠液化、半固體瓊脂穿刺、細菌的運 動性觀察、硫化氫反應等,各實驗均重復3次。具體實驗方法如下:
(1)革蘭氏染色:挑取少量菌苔涂布在載玻片上,風千,在火焰上固定涂片,滴加結 晶紫染色1-2 min,水洗,滴加碘液沖去殘水,并用碘液覆蓋約1 min,水洗。用濾紙吸 去載玻片上的殘水,將玻片傾斜,在白色背景下,用95%的乙醇脫色,直至流出的乙醇 無紫色時,立即水洗。用番紅液復染約2 min,水洗。干燥后,用油鏡觀察。菌體被染 成藍紫色的為革蘭氏陽性菌,被染成紅色的為革蘭氏陰性菌。
(2)芽孢染色:加1-2滴水于小試管中,用接種環挑取2-3環菌苔于試管中,攪拌均勻, 制成濃的菌懸液。加孔雀綠染液2-3滴于小試管中,并使其與菌液混合均勻,然后將試 管置于沸水浴的燒杯中,加熱染色15-20 min。用接種環挑取試管底部菌液數環于潔凈 載玻片上,涂成薄膜,然后將涂片通過火焰3次溫熱固定。水洗,直至流出的水無綠色 為止。用番紅染液染色2-3 min,傾去染液并用濾紙吸干殘液。干燥后用油鏡觀察。芽 孢呈綠色,芽孢囊及營養體為紅色。
(3)尿素酶(Urease)試驗:挑取培養了 18~24h的待試菌培養物接種于液體培養基管 中,搖均,于36°C各培養lOmin,60min和120min,分別觀察結果。若結果為粉紅色為、 則呈陽性。
(4)氧化酶(Oxidase)試驗:在瓊脂斜面上滴加試劑1?2滴,數分鐘內直接觀察結果。 使用Kovacs氏試劑陽性者呈粉紅色或深紫色,Ewing氏改進試劑呈藍色。
(5)過氧化氫酶的測定:將測試菌種接種于合適的培養基斜面上,適溫培養18?24h。 取一干凈的載波片,在上面滴1滴3?10%的H202,挑取1環培養了 18?24h的菌苔純培 養,在H202溶液中涂抹,若有氣泡出現,則為過氧化氫酶陽性,無氣泡者為陰性。
(6)甲基紅(Methyl Red)試驗:挑取新的待試純培養物少許,接種于MR-VP生化 鑒定管,在通用培養基30°C下培養3?5天,從第二天起,每日取培養液lml,加入甲基 紅指示劑1?2滴,觀察結果。陽性呈鮮紅色,弱陽性呈淡紅色,陰性為黃色。從發現陽 性開始到第5天仍為陰性的,即可判定結果。
(7)V-P試驗:將實驗菌接種于通用培養基于36°C培養48h,培養液lml加O’Meara 試劑lml,搖動試管1?2min,靜置于36°C恒溫箱,若4h內不呈現伊紅的紅色即判定為 陰性,聚合物降解菌的分離篩選及鑒定,反之為陽性。
(8)葡萄糖的氧化發酵試驗:以培養18?24h的幼齡菌種,穿刺接種在基礎培養基中, 每株菌接4管,其中2管用油封蓋,以隔絕空氣閉管。另2管不封油為開管,同時留有 不接種的閉管作為對照。適溫培養1、2、4、7天觀察結果。氧化型產酸:僅開管產酸。 發酵型產酸:開管及閉管均產酸。如產氣,則在瓊脂柱內產生氣泡。
(9)硝酸鹽(Nitrate)還原試驗:臨試前將試劑磺胺酸冰醋酸溶液和試液a —萘胺乙醇 溶液各0.2ml等量混合,取混合試劑約0.1ml,加于液體培養基或瓊脂斜面培養物表面, 立即或于lOmin內呈現紅色即為試驗陽性,若無紅色出現則為陰性。
(10)靛基質(Imdole)試驗:將待測菌種接種于試驗培養基管,于36°C培養24h時后, 先加少量乙醚或二甲苯,搖動試管以提取和濃縮靛基質,待其浮于培養液表面后,再沿 試管壁徐徐加入Kovacs氏試劑數滴,觀察結果。若在試劑和培養基接觸面上呈紅色, 即為陽性。
(11)三糖鐵(TSI)瓊脂試驗:以接種針挑取待試菌可疑菌落或純培養物,穿刺接種 并涂布于斜面,置36°C培養18?24h,觀察結果。
(12)氨基酸脫羧酶的測定:用幼齡培養液作為菌種,直接接種。接種后封油,對照管 與測定管同時接種封油。腸肝菌科的細菌于37°C培養4天觀察。當指示劑呈紫色或帶紅 色調的紫色者為陽性,呈黃色者為陰性。對照管應呈黃色反應。
(13)硫化氫(H2S)試驗.•在含有硫代硫酸鈉指示劑的培養基中,沿管壁穿刺接種于 36C培養24~28h,培養基呈黑色為陽性。陰性應繼續培養至6天再觀察結果。
(14)檸檬酸鹽或丙酸鹽的利用:取幼齡菌種接種于斜面上,適溫培養3?7天,培養基 呈堿性(藍色)者為陽性反應,不變者則為陰性。
(15)葡萄糖酸鹽的氧化:用pH7.2的磷酸緩沖液配制成含1%葡萄糖酸鹽的溶液,分 裝試管,每管2mL。挑取30°C溫培養的18~24h的菌落至2mL的葡萄糖酸鹽溶液中制 成濃的菌懸液,置30°C過夜。每管加入0.5mL的斐林試劑,放在沸水浴中加熱10分鐘, 觀察結果。試管中液體由藍色變為黃綠,綠橙色或出現紅色沉淀者為陽性反應,如溶液 不變色者為陰性。
(16)耐鹽性試驗:以肉湯培養液根據鑒定需要,配成不同濃度的NaCl,如2%、3.5%、 5%、7%、10%等。培養基要求十分澄清,接種時應采用幼齡菌液,直針接種,適溫培 養3?7d,與未接種的對照管對比,目測生長情況。
(17)酪素水解試驗(酪蛋白水解):取5g脫脂奶粉加入50mL蒸餾水中,稱1.5g瓊脂 溶于50mL蒸餾水中,將兩液分開滅菌。稍冷卻后將兩液混勻倒平板,即成牛奶平板。 將平板倒置過夜后將菌種點接在平板上。適溫培養1、3、5天,觀察結果,記錄菌落周
圍和下面酪素是否已被分解而呈透明。
(18)苯丙氨酸脫氨試驗:將菌種接種于該培養基斜面上,30°C下溫培養3?7d。取10% 的FeCl3水溶液4滴,滴加在生長菌苔的斜面上,當斜面和試劑液面處呈藍綠色時則為 陽性反應。
(19)產糊精結晶試驗:在大試管中裝碾過的小麥0.5g,碳酸鈣0.2g, H20 10mL,滅 菌后接種,35°C培養3d、5d和7d后,取1滴盧哥爾氏捵液混勻,干燥后,用顯微鏡觀 察有暗褐色或藍色的六角形結晶的糊精,假若大量形成,則排列為扇形或針狀。
(20)在pH5.7營養肉湯上的生長:取菌液一環,接種于上述培養基中,同時接種普通 肉湯液(7.2pH)作對照。適溫培養1?3d后觀察生長情況。
(21)需氧性試驗:用接種環挑取一環肉湯菌液,穿刺接種到基礎培養基中,30°C培養, 在3至7天觀察結果。如細菌在瓊脂柱表面上生長者為好氧菌,如沿著穿刺線上生長者 為厭氧菌或兼性厭氧菌。
(22)淀粉水解試驗:待測菌種培養18?24h得到純培養物,涂布接種于淀粉瓊脂平板, 于36°C培養24~48h,然后將碘試劑直接滴浸于培養表面,立即檢視結果,陽性反應時 淀粉被分解,瓊脂培養基呈深藍色、菌落或培養物周圍出現無色透明環、或肉湯顏色無 變化。陰性反應則無透明環或肉湯呈深藍色。
(23)生長溫度的測定:放置于恒溫水浴培養。聚合物降解菌的分離篩選及鑒定,指示溫度計應放在同樣的試管和培養基 內,在指定溫度下培養2?5d,觀察生長情況。在接近0°C的低溫培養,則觀察時間可延 長至7~10山甚至30d#目測生長情況,與未接種的空白培養基對比,注意混濁度、沉 淀物和懸浮物等項。
(24)形成芽孢的培養基形成芽孢是芽孢桿菌的關鍵性特征,但不是所有的芽孢桿菌都 能在任何條件下形成芽孢。在鑒定細菌時,為了確定是否屬芽孢菌,需要對那些在一般 條件下不形成芽孢的細菌,采用生孢子培養基,來確定是否能形成芽孢。
3實驗結果及討論
3.1菌株的分離篩選形態鑒定結果
經過富集培養基富集,對目標菌株進行分離、純化,共得到2株具有降解HPAM潛 能的菌株。
陜西長慶43-1號油田泥漿池廢液中分離的菌種如圖1所示,命名為CJ419。革蘭氏 染色為陰性,菌株細胞呈小桿狀,可運動;在牛肉膏蛋白胨培養基上為乳白色菌落,光 滑。
4*23號油田泥漿池廢液中富集分離的菌種如圖2所示,命名為FA16。革蘭氏染色為 陽性,菌體為短桿狀,在牛肉膏蛋白胨培養基上為白色菌落,菌落不規則生長、表面有
褶皺.
3. 2面株的生理生化性質鑒定結果
依據《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和 < 常見細菌系統鑒定手冊》, 對菌株CJ419和FA16的分別進行吲哚試驗、接觸酶反應等生理生化特征鑒定,結果見 表24。
表24拮抗菌株CJ419和FA16生理生化特征 Table 2-4 Antagonistic strains CJ419 and FA16 physiological and biochemical characteristics
項目菌株CJ419項目菌株FA16
嚴格好氧+鞭毛數>1
過氧化氫酶+熒光色素-
硝酸鹽還原+在4。<:生長+
淀粉水解+在41°C生長-
吲哚產生-從蔗糖產生果聚糖+
H2S產生-精氨酸雙水解酶+
酪素水解+氧化酶反應+
檸檬酸鹽利用+反硝化+
pH5.7營養肉湯+明膠水解+
V.P試驗+淀粉水解■
溫度45 °C+葡萄糖
利用+
溫度65 °C■海藻糖+
葡萄糖產酸+L-脯氨酸+
乳糖產酸6•苯丙氨酸+
甘露醇產酸 葡萄糖產氣 10%NaCl+
+DL-精氨酸+
由表2>4可知,菌株FA16的生理生化特征與假單胞菌標準株保持一致。通過查閱 《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和《常見細菌系統鑒定手冊》,聚合物降解菌的分離篩選及鑒定,綜合菌 株形態特征和生理生化特征,可初步確定菌株屬于假單胞菌
菌株CJ419的生理生化特征與枯草芽孢桿菌標準菌株保持一致。綜合菌株形態特征 和生理生化特征,通過查閱相關鑒定手冊,可初步確定菌株屬于芽孢桿菌(Bacillus spp.)。
4小結
(1)從聚合物含量很高的陜西長慶43-1號油田泥漿池廢液和4-23號油田廢棄泥漿 池周圍土壤中采樣,將所采集的HPAM污染土樣富集培養基,連續傳代得到富集的 HPAM降解混合菌。取菌液涂布于以HPAM為唯一碳源的篩選養基上,選擇生長良好 的性狀差異明顯的菌落,連續平板劃線純化,通過對樣品的篩選得到對聚丙烯酰胺有高 度適應能力和降解能力的兩株菌株,分別命名為CJ419和FA16。
(2)對兩菌株進行宏觀形態和顯微鑒定、生理生化鑒定,依據《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》和《常見細菌系統鑒定手冊》,最終初步確定CJ419為假單 胞菌FA16 為枯草芽孢桿菌 。
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