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聚丙烯酰胺凝膠電泳原理

發(fā)布日期:2014-08-12 11:15:16
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理
最大的不一樣是聚丙烯酰胺凝膠電泳原理(PAGE)用的蛋白質(zhì)不做任何變性處置
SDS-PAGE中的SDS是十二烷基磺酸鈉,是蛋白質(zhì)變性劑,SDS能離散蛋白質(zhì)的折疊構(gòu)造,然后沿?cái)U(kuò)展的多肽鏈的外表吸附。使肽鏈帶凈負(fù)電荷,蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中的泳動(dòng)速度僅與蛋白質(zhì)顆粒巨細(xì)有關(guān)。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理是由丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱(chēng)Acr)單體和少數(shù)交聯(lián)劑甲叉雙丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱(chēng)Bis)經(jīng)過(guò)化學(xué)催化劑(過(guò)硫酸銨),四甲基乙二胺(TEMED)作為加快劑或光催化聚合效果構(gòu)成的三維空間的高聚物。聚合后的聚丙烯酰胺凝膠構(gòu)成網(wǎng)狀構(gòu)造。具有濃縮效應(yīng)、電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng)。血清蛋白在聚丙烯酰胺凝膠電泳通常可分紅12~25個(gè)組分。因而適用于不一樣相對(duì)分子質(zhì)量物質(zhì)的別離,且別離效果好。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理,效果:用于別離蛋白質(zhì)和寡核苷酸。 聚丙烯酰胺凝膠電泳原理:聚丙烯酰胺凝膠為網(wǎng)狀構(gòu)造,具有分子篩效應(yīng)。它有兩種方式:非變性聚丙烯酰胺凝膠及SDS-聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE);非變性聚丙烯酰胺凝膠,在電泳的進(jìn)程中,蛋白質(zhì)能夠堅(jiān)持完好狀況,并依據(jù)蛋白質(zhì)的分子量巨細(xì)、蛋白質(zhì)的形狀及其所順便的電荷量而逐步呈梯度分隔。
而SDS-PAGE僅依據(jù)蛋白質(zhì)亞基分子量的不一樣就能夠分隔蛋白質(zhì)。該技能開(kāi)端由shapiro于1967年建立,他們發(fā)如今樣品介質(zhì)和丙烯酰胺凝膠中參加離子去污劑和強(qiáng)還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的電泳搬遷率首要取決于亞基分子量的巨細(xì)(能夠疏忽電荷要素)。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理簡(jiǎn)稱(chēng)為PAGE(Polyacrylamide gel electrophoresis)  聚丙烯酰氨凝膠電泳,是以聚丙烯酰胺凝膠作為支撐介質(zhì)的一種常用電泳技能。聚丙烯酰胺凝膠由單體丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺聚合而成,聚合進(jìn)程由自由基催化完結(jié)。催化聚合的常用辦法有兩種:化學(xué)聚合法和光聚合法。化學(xué)聚合以過(guò)硫酸銨(AP)為催化劑,以四甲基乙二胺(TEMED)為加快劑。在聚合進(jìn)程中,TEMED催化過(guò)硫酸銨發(fā)生自由基,后者引發(fā)丙烯酰胺單體聚合,同時(shí)甲叉雙丙烯酰胺與丙烯酰胺鏈間發(fā)生甲叉鍵交聯(lián),然后構(gòu)成三維網(wǎng)狀構(gòu)造。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理依據(jù)其有無(wú)濃縮效應(yīng),分為接連系統(tǒng)和不接連系統(tǒng)兩大類(lèi),接連系統(tǒng)電泳系統(tǒng)中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場(chǎng)效果下,首要靠電荷和分子篩效應(yīng)。不接連系統(tǒng)中因?yàn)榫彌_液離子成分,pH,凝膠濃度及電位梯度的不接連性,帶電顆粒在電場(chǎng)中泳動(dòng)不只有電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),因而其別離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。不接連系統(tǒng)由電極緩沖液、濃縮膠及別離膠所構(gòu)成。濃縮膠是由AP催化聚合而成的大孔膠,凝膠緩沖液為pH6.7的Tris-HCl。別離膠是由AP催化聚合而成的小孔膠,凝膠緩沖液為pH8.9 Tris-HCl。電極緩沖液是pH8.3 Tris-甘氨酸緩沖液。2種孔徑的凝膠、2種緩沖系統(tǒng)、3種pH值使不接連系統(tǒng)構(gòu)成了凝膠孔徑、pH值、緩沖液離子成分的不接連性,這是樣品濃縮的首要要素。
SDS是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑,它能開(kāi)裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,損壞蛋白分子的二、三級(jí)構(gòu)造。而強(qiáng)還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇能使半胱氨酸殘基間的二硫鍵開(kāi)裂。在樣品和凝膠中參加還原劑和SDS后,分子被解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白- SDS膠束,所帶的負(fù)電荷大大超過(guò)了蛋白原有的電荷量,這樣就消除了不一樣分子間的電荷區(qū)別和構(gòu)造區(qū)別。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理通常選用的是不接連緩沖系統(tǒng),與接連緩沖系統(tǒng)相比,能夠有較高的分辨率。
濃縮膠的效果是有堆積效果,凝膠濃度較小,孔徑較大,把較稀的樣品加在濃縮膠上,經(jīng)過(guò)大孔徑凝膠的搬遷效果而被濃縮至一個(gè)狹隘的區(qū)帶。當(dāng)樣品液和濃縮膠選TRIS/HCL緩沖液,電極液選TRIS/甘氨酸。電泳開(kāi)端后,HCL解離成氯離子,甘氨酸解離出少數(shù)的甘氨酸根離子。蛋白質(zhì)帶負(fù)電荷,因而一起向正極移動(dòng),其間氯離子最快,甘氨酸根離子最慢,蛋白居中。電泳開(kāi)端時(shí)氯離子泳動(dòng)率最大,超過(guò)蛋白,因而在后面構(gòu)成低電導(dǎo)區(qū),而電場(chǎng)強(qiáng)度與低電導(dǎo)區(qū)成反比,因而發(fā)生較高的電場(chǎng)強(qiáng)度,使蛋白和甘氨酸根離子敏捷移動(dòng),構(gòu)成以安穩(wěn)的界面,使蛋白集合在移動(dòng)界面附近,濃縮成一中間層。
此鑒定辦法中,蛋白質(zhì)的搬遷率首要取決于它的相對(duì)分子質(zhì)量,而與所帶電荷和分子形狀無(wú)關(guān)。
聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)
一、意圖需求
(1)學(xué)習(xí)聚丙烯酰胺凝膠電泳原理原理和技能
(2)學(xué)習(xí)和把握SDS-聚丙烯酰胺凝膠圓盤(pán)電泳別離蛋白質(zhì)技能
二、試驗(yàn)原理
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理是由丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱(chēng)Acr)單體和少數(shù)交聯(lián)劑甲叉雙丙烯酰胺(簡(jiǎn)稱(chēng)Bis)經(jīng)過(guò)化學(xué)催化劑(過(guò)硫酸銨),四甲基乙二胺(TEMED)作為加快劑或光催化聚合效果構(gòu)成的三維空間的高聚物。聚合后的聚丙烯酰胺凝膠構(gòu)成網(wǎng)狀構(gòu)造。具有濃縮效應(yīng)、電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng)。血清蛋白在聚丙烯酰胺凝膠電泳通常可分紅12~25個(gè)組分。因而適用于不一樣相對(duì)分子質(zhì)量物質(zhì)的別離,且別離效果好。
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理材料的特性
人工合成聚丙烯酰胺凝膠的化學(xué)系統(tǒng)的構(gòu)成及功用:
Acr:丙烯酰胺
Bis:甲叉雙丙烯酰胺
AP:過(guò)硫酸銨——化學(xué)催化劑
TEMED:四甲基乙二胺——加快劑
聚丙烯酰胺凝膠電泳原理是一種陰離子去垢劑,SO32-帶負(fù)電荷。在富含強(qiáng)還原劑的SDS溶液中可構(gòu)成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。因?yàn)榻Y(jié)合很多帶負(fù)電荷的聚丙烯酰胺凝膠電泳原理,比如蛋白質(zhì)穿上帶負(fù)電的“外衣”,蛋白質(zhì)自身帶有的電荷則被掩蓋了。然后起到消除各蛋白質(zhì)分子之間自身的電荷區(qū)別的效果。
三、試驗(yàn)材料
(一)試劑
1、30%丙烯酰胺混合液(Acr:Bis 為29:1) 稱(chēng)取丙烯酰胺(Acr)29g及甲叉丙烯酰胺(Bis)1.0g,用去離子水溶解并稀釋至100ml,貯棕色瓶中于4℃保留,可用一個(gè)月。
2、1.5mol/L pH8.8 Tris-HCl緩沖液  取1mol/L HCL溶液48ml、三羥甲基甲烷(Tris)36.6g,加雙蒸餾水至80ml使其溶解,調(diào)pH至8.8,然后用雙蒸餾水稀釋至100ml,置棕色瓶中,4℃儲(chǔ)存。
3、1.0mol/LpH6.8Tris-HCl緩沖液  取1mol/L HCL溶液48ml,Tris5.98g,加雙蒸餾水至80ml,調(diào)pH6.8,用雙蒸餾水稀釋至100ml,置棕色瓶中,4℃儲(chǔ)存。
4、Tris-甘氨酸電泳緩沖液   稱(chēng)取Tris 6g、甘氨酸28.8g,加蒸餾水850ml,調(diào)pH至8.3,加蒸餾水到1000ml,4℃儲(chǔ)存。用時(shí)可做10倍稀釋。
5、10% 過(guò)硫酸銨(AP)(6)四甲基乙二胺(TEMED)或β-二甲基氨基丙腈(DMAPN)。
6、10%SDS(十二烷基磺酸鈉) 稱(chēng)取SDS 10g,加蒸餾水100ml使其溶解。
7、四甲基乙二胺(TEMED)
8、上樣緩沖液  取1.0mol/LpH6.8Tris-HCl緩沖液6.25ml,蔗糖10g,SDS 2.3g,1g/L溴酚藍(lán)10ml,加蒸餾水溶解,混合至100ml。
9、考馬斯亮藍(lán)染色試劑  考馬斯亮藍(lán)R250染色液:濃度為2.5g/L,用甲醇∶醋酸∶蒸餾水=5∶1∶5的溶液制造(V/V)。
10、脫色液:取冰醋酸7.5ml、甲醇5ml,加蒸餾水至100ml。
11、樣品:人血清。
12、蛋白質(zhì)分子量象征物  市售中分子量蛋白質(zhì)分子量象征物。也可選擇5種以上的已知分子量蛋白質(zhì)自行制造,留意其分子量散布要能滿(mǎn)足需要,各種蛋白質(zhì)的濃度根本持平。
(二)儀器  圓盤(pán)電泳槽(或垂直板電泳槽)、穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀  、脫色搖床。
四、試驗(yàn)辦法
(一)預(yù)備圓盤(pán)電泳槽、電泳儀。
(二)凝膠制備  按下表分別制造別離膠和濃縮膠(此量可供2人用)
別離膠(12%   5ml)        濃縮膠(5%   2ml)
ddH2O        1.6ml        1.4ml
30%混合液        2.0ml        0.33ml
1.5mol/L pH8.8 Tris-HCl        1.3ml        —
1.0mol/L pH6.8 Tris-HCl        —        0.25ml
10%SDS        50µl        20µl
10%Ap        50µl        20µl
TEMED        4µl        4µl
留意:邊配邊平搖燒杯混勻,配好膠后敏捷用滴管灌膠
(三)灌膠
1、先將膠管(5х90mm)封好底,將制造好的別離膠液灌寫(xiě)入膠管內(nèi),約70mm高度(把握別離膠的高度),在凝膠外表悄悄加一層正丁醇液(約3~4mm)。用于隔絕空氣,使膠面平坦。室溫下靜置約30~60min。調(diào)查膠和正丁醇之間的界面,判別膠是不是凝結(jié)。要在承認(rèn)別離膠完全凝結(jié)后才開(kāi)端制造濃縮膠。
2、別離膠凝結(jié)好后,倒掉掩蓋在別離膠外表的正丁醇,并用去離子水沖刷一次,倒置吸凈殘留的水。將制造好的濃縮膠液灌寫(xiě)入膠管內(nèi)(約15mm),在凝膠外表悄悄加一層正丁醇液(約3~4mm),用于隔絕空氣,使膠面平坦。室溫下靜置約30~60min。調(diào)查膠和正丁醇之間的界面,判別膠是不是凝結(jié)。膠凝結(jié)好后,倒掉掩蓋在膠外表的正丁醇,并用去離子水沖刷一次,倒置吸凈殘留的水,預(yù)備加樣。
(四)樣品預(yù)處置和加樣
1、取血清0.1ml、上樣緩沖液0.9ml,混勻,在沸水中煮沸5min。
2、將膠管封底去掉,放入圓盤(pán)電泳槽中,套緊,不能有空的孔,將Tris-甘氨酸電泳緩沖液參加圓盤(pán)電泳上、下槽中,電泳緩沖液要蓋過(guò)膠管口,然后用微量加樣器(或注射器)將樣品10μl加到膠管膠面內(nèi)。
(五)電泳  上槽接負(fù)極,下槽接正極,先調(diào)電壓為120v/濃縮膠,開(kāi)端電泳,當(dāng)指示染料進(jìn)入別離膠后,將電壓增加到80v/別離膠膠,持續(xù)電泳直至染料抵達(dá)距別離膠下端約1cm處,中止電泳,斷開(kāi)電源。電泳時(shí)刻約1.0~1.5h。
(六)考馬斯亮藍(lán)染色
電泳結(jié)束后,取出電泳膠管,用長(zhǎng)注射器針剝膠,一邊灌水一邊推膠,直至膠出。將膠移至大培養(yǎng)皿中,準(zhǔn)確量取并記載凝膠長(zhǎng)度和指示染料的搬遷間隔(別離膠上緣到染料條帶中間間隔),然后將凝膠板浸入考馬斯亮藍(lán)染色液中0.5-1h,再用脫色液脫色1~2天,至背景無(wú)色停止。區(qū)帶可作定性或定量剖析。
(七)校正曲線的數(shù)據(jù)處置和分子量測(cè)定  準(zhǔn)確量取并記載染色后凝膠長(zhǎng)度、各象征蛋白質(zhì)和各待測(cè)蛋白質(zhì)區(qū)帶的搬遷間隔(別離膠上緣到各蛋白質(zhì)區(qū)帶中間)。按下式核算各蛋白質(zhì)的相對(duì)搬遷率(Rm值)。
在半對(duì)數(shù)紙上,以各象征蛋白質(zhì)的Rm值為橫坐標(biāo)(一般標(biāo)準(zhǔn)),相應(yīng)的分子量為縱坐標(biāo)(對(duì)數(shù)尺刻度)作圖,即得分子量校正曲線。依據(jù)各待測(cè)蛋白質(zhì)的Rm值,查此校正曲線,可求各待測(cè)蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量。
五、留意事項(xiàng)
1.制膠進(jìn)程中用正丁醇封住膠面是為了阻止空氣中的氧氣對(duì)凝膠聚合的抑制效果。
2.本法也適合于其他生物樣品中蛋白質(zhì)的剖析。上樣量不宜過(guò)大,不然會(huì)呈現(xiàn)過(guò)載表象。尤其是考馬斯亮藍(lán)R250染色,在蛋白質(zhì)濃度過(guò)高時(shí),染料與蛋白質(zhì)的氨基(-NH)構(gòu)成的靜電鍵不安穩(wěn),其結(jié)合不符合Beer規(guī)律,使蛋白質(zhì)量不準(zhǔn)確。
3.Acr和Bis有神經(jīng)毒性,可經(jīng)肌膚、呼吸道等吸收,故操作時(shí)要留意維護(hù)。
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